依據民國一百年九月二十三日高醫秘字第1001102943號函公布設環保暨安全衛生室，下分環境安全組、生物安全組、輻射防護組。

　　環安室中環境安全組原名為【安全衛生室】，成立於民國八十六年九月一日，成立之宗旨，乃依據教育部於民國八十二年十二月二十日之規定，將全國大專院校之實驗室、試驗室、實習工場、實驗工場等納入勞工安全衛生法適用 對象，故本校成立【安全衛生室】，後於九十六年八月一日改組為【環境安全組】隸屬於本校總務處，近期於民國一百年升格為環保暨安全衛生室，再下分三組。

於民國一百一十一年十二月十二日高雄醫學大學組織規程修正，由原本【環保暨安全衛生室】更名為【環境保護暨職業安全衛生室】，下分安全衛生組、生物安全暨輻射防護組。